Высокогорная Алайская долина расположена на самом юге Кыргызстана. Эта тектоническая впадина, ограниченная с севера Алайским и с юга Заалайским хребтами.
Нарынский Государственный Заповедник расположен в восточной части Нарынской области. Его территория начинается у истока реки Нарын и охватывает склон лесного массива хребта Нарын-Тоо.
Ак Сай- широкая высокогорная долина во внутреннем Тян-Шане, расположена между двумя хребтами на высоте 2900-3800 м, в пограничном районе между Ат Баши и Торугартом.